Khomutova K. G., Ekart A. K., Kravchenko A. N., Tarakanov V. V., Tikhonova I. V. Comparative Estimation of Genetic Diversity and Differentiation of Scots Pine Populations in the Forest-Steppe of Western Siberia using Isozyme and Nuclear Microsatellite

Article

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ (REFERENCES)

Антипова Е. М. Флора внутриконтинентальных островных лесостепей Средней Сибири. Красноярск: Краснояр. гос. пед. ун-т им. В. П. Астафьева, 2012. 662 с. [Antipova E. M. Flora vnutrikontinental’nykh ostrovnykh lesostepey Sredney Sibiri (Flora of the inland island forest-steppes of Central Siberia) Krasnoyarsk: Krasnoyar. gos. ped. un-t im. V. P. Astaf’eva (Krasnoyarsk St. Ped. Univ. named after V. P. Astaf’ev). 2012. 662 p. (in Russian)].

Видякин А. И. Фенетика, популяционная структура и сохранение генетического фонда сосны обыкновенной (Pinus sylvestris L.) // Хвойные бореальной зоны. 2007. Т. 24. № 2–3. С. 159–166 [Vidyakin A. I. Fenetika, populyatsionnaya struktura i sokhranenie geneticheskogo fonda sosny obyknovennoy (Pinus sylvestris L.) (Phenetics, population structure, and conservation of the genetic pool of Scots pine (Pinus sylvestris L.)) // Khvoynye boreal’noy zony (Conifers of the Boreal Zone). 2007. V. 24. N. 2–3. P. 159–166 (in Russian with English abstract)].

Зацепина К. Г., Тараканов В. В., Кальченко Л. И., Экарт А. К., Ларионова А. Я. Дифференциация популяций сосны обыкновенной в ленточных борах Алтайского края, выявленная с применением маркеров различной природы // Сиб. лесн. журн. 2016. № 5. С. 21–32 [Zatsepina K. G., Tarakanov V. V., Kal’chenko L. I., Ekart A. K., Larionova A. Ya. Differentsiatsiya populyatsiy sosny obyknovennoy v lentochnykh borakh Altayskogo kraya, vyyavlennaya s primeneniem markerov razlichnoy prirody (Differentiation of Scots pine populations in the belt pine forests of Altai Krai discovered with markers of various nature) // Sib. lesn. zhurn. (Sib. J. For. Sci.). 2016. N. 5. P. 21–32 (in Russian with English abstract)].

Ильинов А. А., Раевский Б. В. Состояние генофонда сосны обыкновенной Pinus sylvestris L. в Карелии // Сиб. лесн. журн. 2016. № 5. С. 45–54 [Il’inov A. A., Raevskiy B. V. Sostoyanie genofonda sosny obyknovennoy Pinus sylvestris L. v Karelii (The current state of Pinus sylvestris L. gene pool in Karelia) // Sib. lesn. zhurn. (Sib. J. For. Sci.). 2016. N. 5. P. 45–54 (in Russian with English abstract)].

Лесные генетические ресурсы России: изучение, сохранение, использование, управление: колл. моногр. в 2-х кн. / Отв. ред. М. М. Паленова. Кн. 1. Пушкино: ВНИИЛМ, 2024. 545 с. [Lesnye geneticheskie resursy Rossii: izuchenie, sokhranenie, ispolэzovanie, upravlenie: koll. monogr. v 2-kh kn. / Otv. red. M. M. Palenova. Kn. 1 (Forest genetic resources of Russia: study, conservation, use, management: A collective monograph in two books / M. M. Palenova Resp. Ed. Book 1) Pushkino: VNIILM, 2024. 545 p. (in Russian with English abstract)].

Орешкова Н. В., Бондар Е. И., Шаров В. В., Крутовский К. В. Разработка микросателлитных маркеров сосны обыкновенной с длинными мотивами на основе полногеномного de novo секвенирования // Сиб. лесн. журн. 2025. № 1. С. 23–33 [Oreshkova N. V., Bondar E. I., Sharov V. V., Krutovskiy K. V. Razrabotka mikrosatellitnykh markerov sosny obyknovennoy s dlinnymi motivami na osnove polnogenomnogo de novo sekvenirovaniya (Develooment of microsatellite markers with long motifs for Scots pine based on whole genome de novo sequencing) // Sib. lesn. zhurn. 2025. N. 1. P. 23–33 (in Russian with English abstract and references)].

Осипенко А. Е., Ананьев Е. М., Гоф А. А., Савин В. В., Шубин Д. А. История искусственного лесовосстановления в ленточных борах Алтайского края // Изв. Оренбург. гос. агр. ун-та. 2017. № 4 (66). С. 98–101 [Osipenko A. E., Anan’ev E. M., Gof A. A., Savin V. V., Shubin D. A. Istoriya iskusstvennogo lesovosstanovleniya v lentochnykh borakh Altayskogo kraya // Izv. Orenburg. gos. agr. un-ta (Proc. Orenburg St. Agr. Univ.). 2017. N. 4 (66). P. 98–101 (in Russian with English abstract)].

Побединский А. В. Рубки главного пользования. М.: Лесн. пром-сть, 1980. 192 с. [Pobedinskiy A. V. Rubki glavnogo pol’zovaniya (Final felling). Moscow: Lesn. prom-st’ (For. Industry). 1980. 192 p. (in Russian)].

Полежаева М. А. Генетическая изменчивость цитоплазматических маркеров и биогеография лиственниц (Larix Mill., Pinaceae) Дальнего Востока России: автореф. дис. … канд. биол. наук.: 03.00.05. Екатеринбург: ИЭРиЖ УрО РАН, 2010. 20 с. [Polezhaeva M. A. Geneticheskaya izmenchivost’ tsitoplazmaticheskikh markerov i biogeografiya listvennits (Larix Mill., Pinaceae) Dal’nego Vostoka Rossii: avtoref. dis. … kand. biol. nauk.: 03.00.05 (Genetic variability of cytoplasmic markers and biogeography of larches (Larix Mill., Pinaceae) of the Russian Far East: Cand. Biol. Sci. (PhD) thesis: Botany. Yekaterinburg: IERiZH UrO RAN (Inst. Plant and Animal Ecol. Ural Br. Rus. Acad. Sci.), 2010. 20 p. (in Russian)].

Политов Д. В. Генетика популяций и эволюционные взаимоотношения видов сосновых (сем. Pinaceae) Северной Евразии: автореф. дис. … д-ра биол. наук: 03.00.15. М.: Ин-т общ. генет. им. Н. И. Вавилова РАН, 2007. 47 с. [Politov D. V. Genetika populyatsiy i evolyutsionnye vzaimootnosheniya vidov sosnovykh (sem. Pinaceae) Severnoy Evrazii: avtoref. dis. … d-ra biol. nauk: 03.00.15 (Population genetics and evolutionary relationships of pine species (family Pinaceae) of Northern Eurasia: Dr Biol. Sci. (DSc) thesis: Genetics. Moscow: In-t obsshch. genet. im. N. I. Vavilova RAN (Vavilov Inst. Gen. Genet., Rus. Acad. Sci.), 2007. 47 p. (in Russian)].

Санников С. Н., Петрова И. В., Семериков В. Л. Генофеногеографический анализ популяций Pinus sylvestris L. на трансекте от северной до южной границы ареала // Экология. 2002. № 2. С. 97–102 [Sannikov S. N., Petrova I. V., Semerikov V. L. Genofenogeograficheskiy analiz populyatsiy Pinus sylvestris L. na transekte ot severnoy do yuzhnoy granitsy areala (Geno- and phenogeographic analysis of Pinus sylvestris L. populations along the transect extending from the northern to southern boundary of the species range) // Ekologiya (Ecology) 2002. N. 2. P. 97–102 (in Russian with English abstract)].

Санников С. Н., Санникова Н. С., Петрова И. В. Очерки по теории лесной популяционной биологии. Екатеринбург: УрО РАН, 2012. 270 с. [Sannikov S. N., Sannikova N. S., Petrova I. V. Ocherki po teorii lesnoy populyatsionnoy biologii (Outlines of the theory of forest population biology). Yekaterinburg: UrO RAN (Ural Br. Rus. Acad. Sci.), 2012. 270 p. (in Russian with English abstract)].

Семериков В. Л. Дифференциация сосны обыкновенной по аллозимным локусам: автореф. дис. ... канд. биол. наук: 03.00.15. М.: Ин-т общ. ген. им. Н. В. Вавилова РАН, 1991. 21 с. [Semerikov V. L. Differentsiatsiya sosny obyknovennoy po allozimnym lokusam: avtoref. dis. ... kand. biol. nauk: 03.00.15 (Differentiation of Scots pine by allozyme loci: Cand. Biol. Sci. (PhD) thesis: Genetics. Moscow: In-t obshch. gen. im. N. V. Vavilova RAN (Vavilov Inst. Gen. Genet., USSR Acad. Sci.), 1991. 21 p. (in Russian)].

Семериков Л. Ф. Популяционная структура древесных растений (на примере видов дуба европейской части СССР и Кавказа). М.: Наука, 1986. 140 с. [Semerikov L. F. Populyatsionnaya struktura drevesnykh rasteniy (na primere vidov duba evropeyskoy chasti SSSR i Kavkaza) (Population structure of woody plants (using oak species of the European part of the USSR and the Caucasus as an example). M.: Nauka (Science), 1986. 140 p. (in Russian)].

Семериков Н. В., Петрова И. В. Демографическая история сосны обыкновенной в плейстоцене в Северной Евразии и Кавказском регионе на основе анализа ядерных микросателлитных локусов // Сиб. экол. журн. 2023. Т. 30. № 5. С. 573–590 [Semerikov N. V., Petrova I. V. Demograficheskaya istoriya sosny obyknovennoy v pleystotsene v Severnoy Evrazii i Kavkazskom regione na osnove analiza yadernykh mikrosatellitnykh lokusov (Demographic history of Scots pine in the Pleistocene in Northern Eurasia and the Caucasus region based on an analysis of nuclear microsatellite loci) // Sib. ekol. zhurn. (Sib. J. Ecol.). 2023. N. 5. P. 573–590 (in Russian with English abstract)].

Сосна обыкновенная в Южной Сибири / Под ред. Л. И. Милютина. Красноярск: Ин-т леса и древесины им. В. Н. Сукачева СО АН СССР, 1988. 148 с. [Sosna obyknovennaya v Yuzhnoy Sibiri / Pod red. L. I. Milyutina (Scots pine in Southern Siberia / L. I. Milyutin (Ed.)). Krasnoyarsk: In-t lesa i drevesiny im. V. N. Sukacheva SO AN SSSR (V. N. Sukachev Inst. For. and Timber Sib. Br. USSR Acad. Sci.), 1988. 148 p. (in Russian)].

Тараканов В. В. Кальченко Л. И. Фенетический анализ клоновых и естественных популяций сосны в Алтайском крае. Новосибирск: Акад. изд-во «Гео», 2015. 107 с. [Tarakanov V. V. Kal’chenko L. I. Feneticheskiy analiz klonovykh i estestvennykh populyatsiy sosny v Altayskom krae (Phenetic analysis of clonal and natural populations of Pinus sylvestris L. in the Altai Krai). Novosibirsk: Akad. izd-vo «Geo» («Geo» Acad. Publ.), 2015. 107 p. (in Russian with English abstract)].

Тихонова И. В. О необходимости решения экологических проблем сельского и лесного хозяйства России объединением усилий агрономической и лесной науки на ландшафтной основе // Биосфера. 2024. Т. 16. № 3. С. 284–294 [Tikhonova I. V. O neobkhodimosti resheniya ekologicheskikh problem sel’skogo i lesnogo khozyaystva Rossii ob’edineniem usiliy agronomicheskoy i lesnoy nauki na landshaftnoy osnove (The need to solve environmental problems of agriculture and forestry in Russia by combining the efforts of agronomic and forestry science on a landscape basis) // Biosfera. 2024. V. 16. N. 3. P. 284–294 (in Russian with English abstract)].

Тихонова И. В., Экарт А. К., Кравченко А. Н., Зацепина К. Г. Неравновесие распределения генотипов по парам изоферментных локусов в популяциях сосны обыкновенной в лесостепных районах Сибири // Генетика. 2016. Т. 52. № 9. С. 1042–1054 [Tikhonova I. V., Ekart A. K., Kravchenko A. N., Zatsepina K. G. Neravnovesie raspredeleniya genotipov po param izofermentnykh lokusov v populyatsiyakh sosny obyknovennoy v lesostepnykh rayonakh Sibiri (Disequilibrium distribution of genotypes in the pairs of isozyme loci in the pine populations of the forest-steppe regions of Siberia) // Genetika (Genetics). 2016. V. 52. N. 9. P. 1042–1054 (in Russian with English abstract)].

Тихонова И. В., Экарт А. К., Кравченко А. Н., Зацепина К. Г., Тихонова Н. А. Изменчивость генетических nSSR-маркеров в антропогенно-нарушенных популяциях сосны обыкновенной Средней и Западной Сибири: методические аспекты генетического мониторинга // Сиб. экол. журн. 2023. № 5. С. 613–625 [Tikhonova I. V., Ekart A. K., Kravchenko A. N., Zatsepina K. G., Tikhonova N. A. Izmenchivost’ geneticheskikh nSSR-markerov v antropogenno-narushennykh populyatsiyakh sosny obyknovennoy Sredney i Zapadnoy Sibiri: metodicheskie aspekty geneticheskogo monitoringa (Variability of genetic nSSR markers in anthropogenously disturbed Scots pine populations in Middle and Western Siberia: methodological aspects of genetic monitoring) // Sib. ekol. zhurn. (Contemp. Probl. Ecol.). 2023. N. 5. P. 613–625 (in Russian with English abstract)].

Тихонова И. В., Экарт А. К., Кравченко А. Н., Тихонова Н. А. Генетическая изменчивость в популяциях Pinus sylvestris, Picea obovata, Abies sibirica и на вырубках в южной тайге Средней Сибири // Генетика. 2021. Т. 57. № 3. С. 296–310 [Tikhonova I. V., Ekart A. K., Kravchenko A. N., Tikhonova N. A. Geneticheskaya izmenchivost’ v populyatsiyakh Pinus sylvestris, Picea obovata, Abies sibirica i na vyrubkakh v yuzhnoy tayge Sredney Sibiri (Genetic variability in Pinus sylvestris, Picea obovata, and Abies sibirica populations and in felling in the southern taiga of Central Siberia) // Genetika (Genetics). 2021. V. 57. N. 3. P. 296–310 (in Russian with English abstract)].

Хантемирова Е. В., Беркутенко А. Н., Семериков В. Л. Систематика и геногеография Juniperus communis L. по данным изоферментного анализа // Генетика. 2012. Т. 48. № 9. С. 1077–1084 [Khantemirova E. V., Berkutenko A. N., Semerikov V. L. Sistematika i genogeografiya Juniperus communis L. po dannym izofermentnogo analiza (Systematics and gene geography of Juniperus communis L. inferred from isoenzyme data) // Genetika (Genetics). 2012. V. 48. N. 9. P. 1077–1084 (in Russian with English abstract)].

Шигапов З. Х. Сравнительный генетический анализ лесосеменных плантаций и природных популяций сосны обыкновенной // Лесоведение. 1995. № 3. С. 19–24 [Shigapov Z. Kh. Sravnitel’ny geneticheskiy analiz lesosemennykh plantatsiy i prirodnykh populyatsiy sosny obyknovennoy (Comparative genetic analysis of forest seed plantations and natural populations of Scots pine) // Lesovedenie (For. Sci.). 1995. N. 3. P. 19–24 (in Russian with English abstract)].

Шиманюк А. П. Сосновые леса Сибири и Дальнего Востока. М.: Изд-во АН СССР, 1962. 186 с. [Shimanyuk A. P. Sosnovye lesa Sibiri i Dal’nego Vostoka (Pine forests of Siberia and the Far East). Moscow: Izd-vo AN SSSR (USSR Acad. Sci. Publ.), 1962. 186 p. (in Russian)].

Шуваев Д. Н., Ибе А. А., Щерба Ю. Е., Сухих Т. В., Шилкина Е. А., Шеллер М. А., Усова Е. А., Лисотова Е. В., Репях М. В., Ступакова О. М. Молекулярно-генетическая характеристика популяций сосны обыкновенной в Красноярском крае по панели 15 ядерных микросателлитных локусов // Лесоведение. 2022. № 5. С. 530–539 [Shuvaev D. N., Ibe A. A., Shcherba Yu. E., Sukhikh T. V., Shilkina E. A., Sheller M. A., Usova E. A., Lisotova E. V., Repyakh M. V., Stupakova O. M. Molekulyarno-geneticheskaya kharakteristika populyatsiy sosny obyknovennoy v Krasnoyarskom krae po paneli 15 yadernykh mikrosatellitnykh lokusov (Molecular genetic characteristic of the Scots pine population in Krasnoyarsk Krai using the 15 nuclear microsatellite loci panel) // Lesovedenie (For. Sci.). 2022. N. 5. P. 530–539 (in Russian with English abstract)].

Экарт А. К., Ларионова А. Я., Зацепина К. Г., Кравченко А. Н., Жамъянсурэн С., Тихонова И. В., Тараканов В. В. Генетическое разнообразие и дифференциация сосны обыкновенной в Южной Сибири и Монголии // Сиб. экол. журн 2014. № 1. С. 69–78 [Ekart A. K., Larionova A. Ya., Zatsepina K. G., Kravchenko A. N., Zham’yansuren S., Tikhonova I. V., Tarakanov V. V. Geneticheskoe raznoobrazie i differentsiatsiya sosny obyknovennoy v Yuzhnoy Sibiri i Mongolii (Genetic diversity and differentiation of populations of Scots pine in Southern Siberia and Mongolia) // Sib. ekol. zhurn. (Sib. Ecol. J.). 2014. N. 1. P. 69–78 (in Russian with English abstract)].

Devey M. E., Bell J. C., Smith D. N., Neale D. B., Morgan G. F. A genetic linkage map for Pinus radiate based on RFLP, RAPD and microsatellite markers // Theor. Appl. Gen. 1996. V. 92. N. 6. P. 673–679.

Ekart A. K., Larionova A. Ya., Zatsepina K. G., Kravchenko A. N., Zham’yansuren S., Tikhonova I. V., Tarakanov V. V. Genetic diversity and differentiation of populations of Scots pine in Southern Siberia and Mongolia // Contemp. Probl. Ecol. 2014. V. 7. N. 1. P. 52–59 (Original Rus. Text © A. K. Ekart, A. Ya. Larionova, K. G. Zatsepina, A. N. Kravchenko, S. Zham’yansuren, I. V. Tikhonova, V. V. Tarakanov, 2014, publ. in Sibirskii Ekologicheskii Zhurnal. 2014. N. 1. P. 69–78).

Fang P., Niu S., Yuan H., Li Z., Zhang Y., Yuan L., Li W. Development and characterization of 25 EST-SSR markers in Pinus sylvestris var. mongolica (Pinaceae) // Appl. Plant Sci. 2014. V. 2. N. 1. Article 1300057. 4 p.

Hamrick J. L., Godt M. J. W. Allozyme diversity in plant species In: Plant population genetics, breeding, and genetic resources / A. H. D. Brown, M. T. Clegg, A. L. Kahler, B. S. Weir (Eds.). Sunderland, Massachusetts, USA: Sinauer Ass. Inc. Publ., 1990. P. 43–63.

Hantemirova E. V., Berkutenko A. N., Semerikov V. L. Systematics and gene geography of Juniperus communis L. inferred from isoenzyme data) // Rus. J. Gen. 2012. V. 48. N. 9. P. 920–926 (Original Rus. Text © E. V. Hantemirova, A. N. Berkutenko, V. L. Semerikov, 2012, publ. in Genetika. 2012. V. 48. N. 9. P. 1077–1084).

Mantel N. The detection of disease clustering and a generalized regression approach // Cancer Res. 1967. V. 27. Iss. 2. P. 209–220.

Nei M. Genetic distance between populations // The American Naturalist. 1972. V. 106. N. 949. P. 283–292.

Peakall R., Smouse P.E. GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research // Mol. Ecol. Not. 2006. V. 6. Iss. 1. P. 288–295.

Sannikov S. N., Petrova I. V., Semerikov V. L. Geno- and phenogeographic analysis of Pinus sylvestris L. populations along the transect extending from the northern to southern boundary of the species range // Rus. J. Ecol. 2002. V. 33. N. 2. P. 86–91 (Original Rus. Text ©, S. N. Sannikov, I. V. Petrova, V. L. Semerikov, 2002, publ. in Ekologiya. 2002. N. 2. P. 97–102).

Scalfi M., Piotti A., Rossi M., Piovani P. Genetic variability of Italian southern Scots pine (Pinus sylvestris L.) populations: The rear edge of the range // Europ. J. For. Res. 2009. V. 128. Iss. 4. P. 377–386.

Sebastiani F., Pinzauti F., Kujala S. T., González-Martínez S. C., Vendramin G. G. Novel polymorphic nuclear microsatellite markers for Pinus sylvestris L. // Conserv. Gen. Res. 2012. N. 4. Iss. 2. P. 231–234.

Semerikov N. V., Petrova I. V. Demographic history of Scots pine in the Pleistocene in Northern Eurasia and the Caucasus region based on an analysis of nuclear microsatellite loci // Contemp. Probl. Ecol. 2023. Sib. ekol. zhurn. V. 16. N. 5. P. 549–563 (Original Rus. Text © N. V. Semerikov, I. V. Petrova, 2023, publ. in Sibirskii Ekologicheskii Zhurnal. 2023. V. 30. N. 5. P. 573–590).

Sheller M., Tóth E. G., Ciocîrlan E., Mikhaylov P., Kulakov S., Kulakova N., Melnichenko N., Ibe A., Sukhikh T., Curtu A. L. Genetic diversity and population structure of Scots pine (Pinus sylvestris L.) in Middle Siberia // Forests. 2023. V. 14. Iss. 1. Article 119. 13 p.

Soranzo N., Provan J., Powell W. Characterization of microsatellite loci in Pinus sylvestris L. // Mol. Ecol. 1998. V. 7. N. 9. P. 1260–1261.

Tikhonova I. V., Ekart A. K., Kravchenko A. N., Tikhonova N. A. Genetic variability in Pinus sylvestris, Picea obovata, and Abies sibirica populations and in felling in the southern taiga of Central Siberia // Rus. J. Gen. 2021. V. 57. N. 3. P. 297–310 (Original Rus. Text © I. V. Tikhonova, A. K. Ekart, A. N. Kravchenko, N. A. Tikhonova, 2021, publ. in Genetika. 2021. V. 57. N. 3. P. 296–310).

Tikhonova I. V., Ekart A. K., Kravchenko A. N., Zatsepina K. G. Disequilibrium distribution of genotypes in the pairs of isozyme loci in the pine populations of the forest-steppe regions of Siberia // Rus. J. Gen. 2016. V. 52. N. 9. P. 926–938 (Original Rus. Text © I. V. Tikhonova, A. K. Ekart, A. N. Kravchenko, K. G. Zatsepina, 2016, publ. in Genetika. 2016. V. 52. N. 9. P. 1042–1054).

Tikhonova I. V., Ekart A. K., Kravchenko A. N., Zatsepina K. G., Tikhonova N. A. Variability of genetic nSSR markers in anthropogenously disturbed Scots pine populations in Middle and Western Siberia: methodological aspects of genetic monitoring // Contemp. Probl. Ecol. 2023. V. 16. N. 5. P. 583–592 (Original Rus. Text © I. V. Tikhonova, A. K. Ekart, A. N. Kravchenko, K. G. Zatsepina, N. A. Tikhonova, 2023, publ. in Sibirskii Ekologicheskii Zhurnal. 2023. V. 30. N. 5. P. 613–625).

Wójkiewicz B., Litkowiec M., Wachowiak W. Contrasting patterns of genetic variation in core and peripheral populations of highly outcrossing and wind pollinated forest tree species // AoB Plants. 2016. V. 8. Article plw054. 13 p.

Żukowska W. B., Wojkiewicz B, Lewandowski A , Laszlo R, Wachowiak W. Genetic variation of Scots pine (Pinus sylvestris L.) in Eurasia: impact of postglacial recolonization and human‑mediated gene transfer // Ann. For. Sci. 2023. V. 80. N. 1. Article 42. 19 p.